Marqueurs moléculaires ciblés dérivés de la génomique pour le pronostic des corticosurrénalomes
A. Jouinot*a (Dr), G. Assiéb (Pr), M. Fassnachtc (Pr), R. Libéb (Dr), B. Doussetd (Pr), S. Sbierae (Dr), C. Ronchie (Dr), M. Kroissf (Dr), E. Korpershoekg (Dr), R. De Krijgerh (Pr), J. Waldmanni (Pr), M. Quinklerj (Pr), A. Tabarink (Pr), O. Chabrel (Pr), M. Luconim (Dr), M. Mannellim (Pr), L. Groussinb (Pr), E. Baudinn (Dr), L. Amaro (Dr), F. Beuschleinp (Pr), J. Bertheratb (Pr)
a Oncologie, AP-HP hôpital Cochin - Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris, FRANCE ; b Endocrinologie, AP-HP hôpital Cochin - Institut Cochin, INSERM U1016, CNRS UMR8104, Université Paris Descartes, Paris, FRANCE ; c Endocrinology and Diabetes Unit, University Hospital - Comprehensive Cancer Center Mainfranken, University of Würzburg, Wuerzburg, ALLEMAGNE ; d Chirurgie digestive et endocrinienne, AP-HP hôpital Cochin, Paris, FRANCE ; e Endocrinology and Diabetes Unit, University Hospital, University of Würzburg, Wuerzburg, ALLEMAGNE ; f Comprehensive Cancer Center Mainfranken, University of Würzburg, Wuerzburg, ALLEMAGNE ; g Department of Pathology, Erasmus MC University Medical Center, Rotterdam, PAYS-BAS ; h Department of Pathology, Erasmus MC University Medical Center - Department of Pathology, Reinier de Graaf Hospital, Rotterdam, PAYS-BAS ; i Department of Surgery, University Hospital Giessen and Marburg, Marburg, ALLEMAGNE ; j Department of Medicine, Charite University, Berlin, ALLEMAGNE ; k Endocrinologie, diabète et nutrition, CHU hôpitaux de Bordeaux, Bordeaux, FRANCE ; l Endocrinologie, CHU de Grenoble, Grenoble, FRANCE ; m Department of Experimental and Clinical Biomedical Sciences, University of Florence, Florence, ITALIE ; n Médecine Nucléaire et de Cancérologie Endocrinienne, Institut Gustave Roussy, Villejuif, FRANCE ; o Hypertension artérielle, affections rénales et cardiovasculaires, Paris, FRANCE ; p Medizinische Klinik und Poliklinik IV, Ludwig-Maximilians-Universität München, Munich, ALLEMAGNE
* anne.jouinot@aphp.fr
Les corticosurrénalomes ont un pronostic hétérogène. Récemment les études pangénomiques ont décrit des altérations spécifiques : transcriptome "C1A" (expression de gènes de la prolifération / cycle cellulaire) versus "C1B", méthylome "CIMP" (hyperméthylation des îlots CpG) versus "non-CIMP", altérations chromosomiques "Bruité" (nombreuses cassures anarchiques) versus "Chromosomal" (pertes d'hétérozygotie étendues) et "Calme" (altérations limitées), mutations somatiques récurrentes dans 20 gènes. Ces altérations convergent en une classification en 3 groupes corrélant avec le pronostic.
Objectif : développer et valider des marqueurs moléculaires ciblés reflétant ces groupes génomiques.
Patients et méthodes : 245 corticosurrénalomes de 21 centres français (COMETE) et européens (ENSAT) ont été inclus. Nous avons analysé l’expression différentielle BUB1B-PINK1 par RT-qPCR sur l’ARN (n=135), les altérations chromosomiques par puces SNP (n=238), les mutations de 20 gènes drivers par NGS ciblé (n=251) et la méthylation des îlots CpG de 4 gènes (PAX5, GSTP1, PYCARD, PAX6) par MS-MLPA (n=221) sur l’ADN tumoral.
Résultats : Les marqueurs ciblés identifiaient :
- 50% "C1A", 38% "C1B" et 12% indéterminé
- 44% "CIMP" et 56% "non-CIMP"
- 55% "Chromosomal", 32% "Bruité" et 13% "Calme"
- mutations ou délétions : 21% ZNFR3, 17% TP53, 11% CTNNB1 et 10% CDKN2A.
L’ensemble des marqueurs ciblés étaient disponibles pour 107 tumeurs. 87/107 (81%) reflétaient de manière concordante les 3 groupes identifiés par la génomique : 37 "C1A/CIMP", 18 "C1A/non-CIMP" et 32 "C1B/non-CIMP". On observait 34/37, 7/18 et 1/32 décès dans ces 3 groupes respectifs (Fisher p <10-15).
Conclusion : Les marqueurs moléculaires ciblés peuvent résumer la classification génomique des corticosurrénalomes et sa valeur pronostique.
L’auteur n’a pas transmis de déclaration de conflit d’intérêt.